| ชื่อบทความ |
Structural properties and stability of PNA with (2R,4R)- and (2R,4S)-prolyl-(1S,2S)-2-aminocyclopentanecarboxylic acid backbone binding to DNA: A molecular dynamics simulation study |
| วัน/เดือน/ปี ที่ได้ตอบรับ |
15 ตุลาคม 2556 |
| วารสาร |
| ชื่อวารสาร |
Chemical Physics Letters |
| มาตรฐานของวารสาร |
|
| หน่วยงานเจ้าของวารสาร |
Chemical Physics Letters |
| ISBN/ISSN |
|
| ปีที่ |
|
| ฉบับที่ |
|
| เดือน |
|
| ปี พ.ศ. ที่พิมพ์ |
2556 |
| หน้า |
|
| บทคัดย่อ |
The structural properties and stability of two different stereoisomers of (1S,2S)-2-aminocyclopentanecarboxylic acid (acpcPNA) binding to DNA and self hybrid DNA duplex were investigated using a molecular dynamics simulation. The thermodynamics stability was estimated and revealed that the stability of the simulated duplexes is of the order of (2R,4R)-acpcPNA•DNA > (2R,4S)-acpcPNA•DNA > DNA•DNA, which is in good agreement with experimental thermal stability. The lowest stability of DNA duplex is caused by a repulsion of two negatively charged backbones. The repulsion is decreased significantly by replacing a non-charged acpcPNA backbone, leading to a strong binding ability of acpcPNA with its complementary DNA. |
| คำสำคัญ |
Molecular dynamics simulation, Binding free energy, Peptide nucleic acid, PNA-DNA duplex, pyrrolidinyl PNA |
| ผู้เขียน |
|
| การประเมินบทความ |
มีผู้ประเมินอิสระ |
| สถานภาพการเผยแพร่ |
ได้รับการตอบรับให้ตีพิมพ์ |
| วารสารมีการเผยแพร่ในระดับ |
นานาชาติ |
| citation |
มี |
| เป็นส่วนหนึ่งของวิทยานิพนธ์ |
เป็น |
| แนบไฟล์ |
|
| Citation |
0
|
|
|
ข้อมูลการเผยแพร่ผลงาน
การเผยแพร่ในรูปของบทความวารสารทางวิชาการ
English