ชื่อบทความที่เผยแพร่ |
The binding properties of PNA•DNA duplexes: A molecular dynamics study |
วัน/เดือน/ปี ที่เผยแพร่ |
27 มีนาคม 2556 |
การประชุม |
ชื่อการประชุม |
The 17th International Annual Symposium on Computational Science and Engineering (ANSCSE17) |
หน่วยงาน/องค์กรที่จัดประชุม |
คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยขอนแก่น ประเทศไทย และสมาคมวิทยาการและวิศวกรรมเชิงคอมพิวเตอร์ |
สถานที่จัดประชุม |
คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยขอนแก่น |
จังหวัด/รัฐ |
จังหวัดขอนแก่น |
ช่วงวันที่จัดประชุม |
27 มีนาคม 2556 |
ถึง |
29 มีนาคม 2556 |
Proceeding Paper |
Volume (ปีที่) |
17 |
Issue (เล่มที่) |
- |
หน้าที่พิมพ์ |
63-69 |
Editors/edition/publisher |
- |
บทคัดย่อ |
Molecular dynamics (MD) simulations of nucleic acid double strands were performed in
aqueous solution. The simulated systems were aegPNA, acpcPNA(4R), acpcPNA(4S) and
DNA with GTAGATCACT sequence binding to its complementary sequence of DNA strand
in anti-parallel direction. The MD structures were stable along the simulation time. The
binding free energies (ΔGbinding) calculated using molecular mechanics combined with
generalized Born and surface area method of PNA•DNA duplexes are larger negative than
that of DNA•DNA, indicating the high stability of PNA compared with DNA system. By
comparing the stability of PNA•DNA duplexes, one found that acpcPNA(4R) •DNA resulted
the highest negative ΔGbinding. This stability is in agreement with the experimentally thermal
stability. |
ผู้เขียน |
|
การประเมินบทความ (Peer Review) |
มีผู้ประเมินอิสระ |
มีการเผยแพร่ในระดับ |
นานาชาติ |
รูปแบบ Proceeding |
Full paper |
รูปแบบการนำเสนอ |
Oral |
เป็นส่วนหนึ่งของวิทยานิพนธ์ |
เป็น |
ผลงานที่นำเสนอได้รับรางวัล |
ไม่ได้รับรางวัล |
แนบไฟล์ |
|
Citation |
0
|
|