| ชื่อบทความที่เผยแพร่ |
Biological factors affect the distribution of Burkholderia pseudomallei in soils |
| วัน/เดือน/ปี ที่เผยแพร่ |
20 กันยายน 2556 |
| การประชุม |
| ชื่อการประชุม |
7 th WMC 2013 WORD MELIOIDOSIS CONGRESS 2013 |
| หน่วยงาน/องค์กรที่จัดประชุม |
Mahidol Unversity, Wellcome Trust-Mahidol Unversity-Oxford Tropical Medicine Research programme |
| สถานที่จัดประชุม |
Royal Orchid Sheraton Hotel & Towers |
| จังหวัด/รัฐ |
กรุงเทพมหานคร |
| ช่วงวันที่จัดประชุม |
18 กันยายน 2556 |
| ถึง |
20 กันยายน 2556 |
| Proceeding Paper |
| Volume (ปีที่) |
1 |
| Issue (เล่มที่) |
1 |
| หน้าที่พิมพ์ |
166 |
| Editors/edition/publisher |
|
| บทคัดย่อ |
Burkholderia pseudomallei is a saprophytic bacteria resides in soil and stagnant water in endemic areas. B. pseudomallei is unevenly distributed in soil where the effective control methods for this pathogen is still appear to be limited. Studies on biological factors of soil, of which is the diversity of microbe in soil are important to understand the microbial community that might contribute to the survival of B. pseudomallei. The metagenomics strategy was used to investigate the population of microbes in soil in the presence and absence of B. pseudomallei. Soil physicochemical properties of the same site were also investigated. DNA extracted from 6 B. pseudomallei positive soil samples where number of DNA copies was found to be higher than colony number obtained from the direct culture method and 3 negative soil sites were selected. The DNA samples were amplified by PCR using universal primers for 16S rRNA gene that encompass bacteria in soil followed by 454 pyrosequencing to study soil bacterial community. The data were analyzed by RDP's Pyrosequencing Pipeline program. Six soil samples, when analyzed by 454 pyrosequencing indicated more acidobacteria group than the negative soil samples. On the other hand, soil sample without B. pseudomallei contained more Bacilli bacteria than soils sample with B. pseudomallei. The presence of acidobacteria group in positive soil is correlated with the acidic environment found in the presence of the bacteria. Further investigation is required to explore the contribution of them with B. pseudomallei in the same soil community. Organisms found in negative soil sites may produce antimicrobial substances or some inhibitors that influence the microbial ecology. These information will help us develop a tool to control or reduce the pathogenic organism in soil, which will decrease the possible infection of B. pseudomallei.
Keywords: Burkholderia pseudomallei, soil, Metagenomics, Pyrosequencing
|
| ผู้เขียน |
|
| การประเมินบทความ (Peer Review) |
ไม่มีผู้ประเมินอิสระ |
| มีการเผยแพร่ในระดับ |
นานาชาติ |
| รูปแบบ Proceeding |
Abstract |
| รูปแบบการนำเสนอ |
Poster |
| เป็นส่วนหนึ่งของวิทยานิพนธ์ |
เป็น |
| ผลงานที่นำเสนอได้รับรางวัล |
ไม่ได้รับรางวัล |
| แนบไฟล์ |
|
| Citation |
0
|
|
|
ข้อมูลการเผยแพร่ผลงาน
การเผยแพร่ในรูปของบทความวารสารทางวิชาการ
English