ชื่อบทความ |
Insight into a conformation of the PNA-PNA duplex with (2′R,4′R)- and
(2′R,4′S)-prolyl-(1S,2S)-2-aminocyclopentanecarboxylic acid backbones |
วัน/เดือน/ปี ที่ได้ตอบรับ |
14 มีนาคม 2561 |
วารสาร |
ชื่อวารสาร |
Chemical Physics Letters |
มาตรฐานของวารสาร |
SCOPUS |
หน่วยงานเจ้าของวารสาร |
elsevier |
ISBN/ISSN |
0009-2614 |
ปีที่ |
|
ฉบับที่ |
|
เดือน |
|
ปี พ.ศ. ที่พิมพ์ |
2561 |
หน้า |
|
บทคัดย่อ |
Suitable conformations for peptide nucleic acid (PNA) self-hybrids with (2′R,4′R)- and (2′R,4′S)-prolyl-(
1S,2S)-2-aminocyclopentanecarboxylic acid backbones (namely, acpcPNA and epi-acpcPNA, respectively)
were investigated based on molecular dynamics simulations. The results revealed that hybridization of
the acpcPNA was observed only in the parallel direction, with a conformation close to the P-type structure.
In contrast, self-hybrids of the epi-acpcPNA were formed in the antiparallel and parallel directions; the antiparallel
duplex adopted the B-form conformation, and the parallel duplex was between B- and P-forms. The
calculated binding energies and the experimental data indicate that the antiparallel epi-acpcPNA self-hybrid
was more stable than the parallel duplex. |
คำสำคัญ |
Peptide nucleic acid PNA conformation Molecular dynamics simulation Binding energy |
ผู้เขียน |
|
การประเมินบทความ |
มีผู้ประเมินอิสระ |
สถานภาพการเผยแพร่ |
ได้รับการตอบรับให้ตีพิมพ์ |
วารสารมีการเผยแพร่ในระดับ |
นานาชาติ |
citation |
ไม่มี |
เป็นส่วนหนึ่งของวิทยานิพนธ์ |
เป็น |
แนบไฟล์ |
|
Citation |
0
|
|