ชื่อบทความ |
การศึกษาคุณลักษณะของลำดับดีเอ็นเอโปรเฟจในตัวอย่างทางคลีนิกของ Streptococcus agalactiae ในประเทศไทย |
วัน/เดือน/ปี ที่ได้ตอบรับ |
3 มีนาคม 2564 |
วารสาร |
ชื่อวารสาร |
วารสารวิจัยสถาบัน มข. |
มาตรฐานของวารสาร |
TCI |
หน่วยงานเจ้าของวารสาร |
สำนักงานอธิการบดี กองบริหารงานวิจัย |
ISBN/ISSN |
|
ปีที่ |
1 |
ฉบับที่ |
3 |
เดือน |
กันยายน-ธันวาคม 2563 |
ปี พ.ศ. ที่พิมพ์ |
2564 |
หน้า |
|
บทคัดย่อ |
บทคัดย่อ
Group B Streptococcus (GBS) สามารถก่อโรครุนแรงได้ในเด็กอ่อน ผู้สูงอายุ หรือผู้มีโรคประจำตัว เชื้อ GBS บางสายพันธุ์มีความสัมพันธ์กับความรุนแรงของโรค หรือการระบาดในบางภูมิภาค ความหลากหลายทางสายพันธุ์ของแบคทีเรียอาจเกิดจากปัจจัยหลายอย่างรวมถึงแบคเทอริโอเฟจ หรือเฟจ โดยเฉพาะอย่างยิ่ง Temperate phage ในระหว่างการติดเชื้อแบบ Lysogenic infection โปรเฟจ (Prophage) ทำให้แบคทีเรียมียีนเพิ่มหรือลดลงได้ ในประเทศไทยยังไม่มีรายงานความสัมพันธ์ของโปรเฟจ และความรุนแรงของการติดเชื้อ และลักษณะทางระบาดวิทยาของ GBS ในการศึกษานี้ ต้องการศึกษาลักษณะของโปรเฟจในตัวอย่างทางคลินิกของ GBS ในประเทศไทย ด้วยเทคนิค Polymerase chain reaction (PCR) และการวิเคราะห์โปรเฟจในจีโนมด้วย PHASTER โดยเชื้อ GBS จากตัวอย่างต่าง ๆ จากโรงพยาบาลในหลายภูมิภาค 108 ตัวอย่าง นำมาวิเคราะห์หาโปรเฟจโดยวิธี PCR กับไพรเมอร์ 6 คู่ นอกจากนี้เชื้ออีก 9 ตัวอย่าง ยังนำมาวิเคราะห์ข้อมูลจีโนมด้วย PHASTER เทียบกับข้อมูลจีโนมในแหล่งข้อมูลสาธารณะของเชื้อสายพันธุ์เดียวกัน 7 ตัวอย่าง ผลการศึกษาด้วยเทคนิค PCR พบว่า 88.0% ของเชื้อ มีโปรเฟจอย่างน้อย 1 ชนิด โดยพบ Phage major capsid protein HK97 family พบมากที่สุด 51.0% การปรากฎของโปรเฟจถูกจำแนกเป็น 32 รูปแบบ โดยรูปแบบที่ 4 คือ BRO domain protein, prophage antirepressor prophage Sa05 พบมากที่สุดถึง 14.7% ผลการวิเคราะห์จีโนมด้วย PHASTER ทั้ง 16 ตัวอย่าง พบว่ามีโปรเฟจชนิดสมบูรณ์ Phage strept 315.3 มากที่สุด 77.8% และ 71.4% จากเชื้อในประเทศไทยและฐานข้อมูลสาธารณะ ตามลำดับ นอกจากนี้ยังพบโปรเฟจที่พบเฉพาะเชื้อจากประเทศไทย ได้แก่ Phage strept T12, Phage strept Str PAP, Phage strept phi3396 และ Phage strept 20617 กล่าวโดยสรุปการศึกษานี้แสดงให้เห็นว่า เชื้อ GBS ที่แยกได้จากผู้ป่วยติดเชื้อในประเทศไทยส่วนใหญ่มีโปรเฟจอยู่ในจีโนม และมีความหลากหลายของชนิดโปรเฟจที่พบ แต่ข้อมูลที่ได้ไม่สนับสนุนความสัมพันธ์ระหว่างโปรเฟจกับการก่อโรคหรือสายพันธุ์กับการระบาด ข้อมูลลักษณะของโปรเฟจที่ได้นี้เป็นข้อมูลสำคัญสำหรับการศึกษาที่เกี่ยวข้องกับการใช้ประโยชน์จากแบคเทอริโอเฟจเพื่อควบคุมเชื้อ GBS ในอนาคต
|
คำสำคัญ |
S. agalactiae, Prophage |
ผู้เขียน |
|
การประเมินบทความ |
มีผู้ประเมินอิสระ |
สถานภาพการเผยแพร่ |
ได้รับการตอบรับให้ตีพิมพ์ |
วารสารมีการเผยแพร่ในระดับ |
ชาติ |
citation |
ไม่มี |
เป็นส่วนหนึ่งของวิทยานิพนธ์ |
เป็น |
แนบไฟล์ |
|
Citation |
0
|
|